首先，企业需要建立严格的内部管理制度。该制度应包括以下几个方面：明确财务审批流程、规定预算管理制度、建立会计核算规定等。这些制度的建立可以帮助企业在员工管理、财务管理、工作流程等方面实现规范化、科学化、透明化。

其次，企业需要强化对员工的教育和培训。员工是企业的核心资源，企业需要加强对员工的培训与教育，提高员工的责任心和风险意识，从而有效遏制停息挂账问题。

进一步，企业需要引入信息化手段，提高管理效率和监督能力。信息化手段能够使企业实现数据共享和信息互通，帮助企业更好地控制各类成本，从而遏制停息挂账问题。

最后，企业内部管理需要实现流程标准化。制定明确详细的流程标准，在落实过程中加强内部审批、监督与检查，实现有效的管控，防止停息挂账的产生。

在法律层面分析，在企业内部管理中存在停息挂账问题将会引起政府部门的关注，公司可能面临罚款、经济损失等严重后果，甚至面临资质的吊销。