农村信用社便民卡是农村地区广泛使用的一种支付方式。作为一种类似于银行卡的电子支付方式，其使用和管理规定与银行卡类似。但是，类似于信用卡的信用额度和还款问题，农村信用社便民卡的使用也存在一些问题。

其中最常见的问题之一就是逾期问题。有些用户不按时还款，从而产生了一些利息和违约金等费用。这些费用会自动从用户的绑定的银行卡中扣除。但是，有时候用户还了欠款后，却发现自己的银行卡中并没有扣除相关费用。

为什么会出现这种情况呢？其根本原因是因为银行系统的处理流程存在一定的延迟。通常情况下，用户还款后，信用社会将这笔还款信息上传至银行系统。然而，银行系统并不是实时处理这些信息，而是每天晚上进行批量处理。因此，用户还款后，可能需要等待一天的时间，才能看到银行卡中相应的扣款记录。在这段时间内，用户会发现即使还了款项，却并没有扣除利息和违约金。

当然，除了银行系统的延迟处理问题，也存在其他例如网络问题、数据传输问题等原因导致用户还清欠款后，却发现银行卡中依然没有扣除相应的费用。

针对这种情况，用户可以先确认自己的还款是否已经到账，如果已经到账，也可以耐心等待一段时间，或者联系农村信用社或者银行客服处理。

总之，农村信用社便民卡的使用方便了农村地区的居民。但是，在使用过程中，也需要遵守管理规定，按时还款，避免产生一些额外的费用和不必要的麻烦。如果遇到问题可以及时和相关部门沟通解决，以免影响个人信用记录。