绝对回答：如果贷款人逾期还款，即使有存款，银行也有权扣除其存款以弥补逾期款项。这是因为逾期还款已经违反了贷款协议，银行可以通过扣款来保障自己的利益。

首先，需要明确的是，贷款逾期是一种违反贷款协议的行为，按照《合同法》的规定，银行有权采取适当的措施保障自己的权益。因此，即使贷款人有存款，银行也有权扣除其存款以弥补逾期款项。

其次，贷款不仅仅是双方之间的一种债权债务关系，更是银行的一项业务。银行需要通过贷款来获取利润，而如果贷款人逾期不还款，银行将会面临资金困难甚至亏损的局面。因此，银行有必要采取措施来保障自己的利益，扣除贷款人的存款就是其中一种常见的措施。

最后，需要注意的是，银行扣款应该是在符合法律程序的情况下进行的。贷款人应该通过正常途径与银行沟通，了解具体的扣款方式和流程，并按照银行要求提供相关证明材料。如果银行采取的扣款方式存在不合理之处，贷款人可以通过法律途径来维护自己的权益。

总之，贷款逾期会导致银行采取措施来保障自己的利益，即使贷款人有存款也不例外。银行的扣款应该在符合法律程序的情况下进行，贷款人应该按照银行要求提供相关证明材料，同时需要注意维护自己的权益。