同业借款是银行间市场之间的资金借贷业务，同业之间互相借贷资金以满足资金的流动性和短期投资需求。但是，同业之间的借款本金或利息可能会出现逾期情况，导致违约金的计算问题。

在同业借款逾期情况下，银行通常会加收违约金。违约金的计算方式因不同银行而异，并主要有以下两种方式：

第一种方式是按逾期本金或利息的一定比例收取违约金。一般情况下，银行会设定逾期违约金的比例，比如按照逾期本金或利息的每天1‰或1%进行计算。这种方式比较简单明了，较为常见。但是该方式的缺点是不够灵活，无法根据具体情况灵活调整比例。

第二种方式是按当时同业市场的利率和累积逾期天数进行计算。例如，当时同业市场的利率为4%，若逾期7天，则违约金为7天×4%÷360×逾期本金或利息。这种方式相对较为复杂，但是灵活性较高，可以根据当时市场情况和违约程度进行调整。

总之，在同业借款逾期时，银行会加收一定比例的违约金。其中，违约金的计算方式主要有按逾期本金或利息的比例收取和按同业市场利率和逾期天数进行计算。不同银行的计算方式可能存在差异，具体应根据银行的相关规定进行处理。同时，在同业借款过程中，企业应注意严格遵守相关条款，避免不必要的违约风险。