在进行网贷逾期后与公司协商还款金额最合适的答案为“尽可能多还，只留最低还款额”。

首先，逾期还款会导致信用记录受损，影响个人信用评级和申请贷款等。为了避免信用记录进一步恶化，尽可能多还款是必要的。

其次，如果还款能力有限，则应根据自身实际情况选择合适的还款金额，但同时要清楚知道逾期后产生的利息、滞纳金等费用。只留最低还款额将会让利息、滞纳金等费用不断累计，导致还款总额更多。

最重要的是，避免和贷款公司产生信任危机，多沟通、合理协商，能够让双方都能得到一定的利益。如果遇到还款问题，及时与贷款公司沟通和协商能够降低发生债务纠纷的风险，使得还款计划更加稳定。

综上所述，网贷逾期后与公司协商还款金额最合适的方法是尽可能多还，只留最低还款额。而在进行还款计划协商过程中，多方面考虑自身实际情况和借款公司的经济状况，积极与贷款公司沟通协商，这些做法能够降低借款人和给贷款公司带来的风险。

最后，通过法律的角度，如果还款人不履行还款责任，在借款合同中约定的违约金、利息和滞纳金将会成为合法的赔偿要求。同时，贷款公司也有权采取法律手段，如起诉或强制执行等，督促借款人还款。因此，相信通过以上措施，能够避免逾期产生的不良后果。