是的，年费逾期会影响公积金贷款。 这是因为公积金贷款需要提供贷款申请人的信用记录，如果年费逾期，则会影响申请人的信用记录，进而影响贷款审批结果。

一方面，年费逾期会对申请人的信用记录产生不良影响。公积金贷款对申请人的信用记录要求较高，这个记录是由央行征信系统统计和展示的。一旦逾期，信用记录上面就会显示申请人存在逾期行为，这对申请贷款的申请人是十分不利的。银行往往会因此产生疑虑并在贷款审批过程中拒绝贷款申请。

另一方面，逾期也会影响申请人的还款能力。一旦逾期，银行会收取高额的滞纳金，并继续收取高额的利息费用。而这些意外的额外费用会进一步增加申请人的还款成本。如果申请人无法及时还款，将会导致滞纳金逐渐累积，应付的债务将难以承担，这将显著降低借款人的还款能力。

从法律角度来看，逾期还款可能会触及法律边界。《民法典》规定：“借款人应当按照合同的约定向借款人偿还借款本金和利息，同意用抵押物偿还借款人债务的，在合同约定的期限内提供抵押物。如借款人有其他返还义务的，应当按照约定履行其他返还义务。”在公积金贷款中，未能按时偿还借款且未能交付抵押物的申请人将会违反合同。如果未能履行还款义务，银行可能会采取诉讼等法律手段来规避借款人的逃避还款行为。

总体而言，年费逾期的行为将影响申请人的公积金贷款信用记录，进而导致贷款被拒绝或者增加贷款成本。而这些变化对申请人将会造成很大的困扰和不良影响。因此，申请人在年费到期之前需尽早还上透支款，保持良好的信用记录。