贷款逾期90天从那天算起的答案是：从最后还款日起算。

这是因为在贷款合同中通常规定了最后还款日，即借款人需要在该日之前还清所有欠款。如果借款人在最后还款日之后未还款，则相当于发生了逾期。从此时开始，银行或借款人可以采取各种措施追讨欠款。

另外，如果合同中规定了利息计算方式，那么逾期之后的利息也应该从最后还款日起算。逾期利息通常比正常利息高出很多，因此借款人应该尽早还清欠款，以免造成更大的经济压力。

除此之外，还有一种可能是银行或借款人在逾期后与借款人协商达成了还款计划，但是借款人仍未按照计划还款。此时，逾期时间应该从最后还款日开始算，而不是从协商达成日开始算。

从法律角度来看，如果借款人逾期超过90天，则银行有权向法院申请强制执行，包括查封借款人财产、强制执行借款人的工资等。因此，借款人应该遵守还款合同，如有实在困难可与银行协商解决。